O ministro da Educação, Abraham Weintraub, nomeou no dia 28 de maio Leonardo de Souza Leão para o cargo de diretor de gestão do FNDE, porém no último dia 11 de julho, o atual comandante da Educação decidiu em apenas 41 dias exonerar Leonardo, que é um importante auxiliar do ex-ministro Mendonça Filho, e atuou ao seu lado durante a sua gestão no MEC.

Vários deputados e prefeitos pernambucanos lamentaram o ocorrido, uma vez que Leonardo Leão no FNDE tinha condições de ajudar a Pernambuco, estando numa posição estratégica de liberação de recursos e emendas orçamentárias aos municípios do estado.

Causou estranheza a demissão, uma vez que Mendonça é correligionário do ministro da Casa Civil, Onyx Lorenzoni.